Uvesti reakcioni rastvarač u posudu kroz ventil za odzračivanje da bi se isprao veći deo ostatka; zatim posudu do pola napunite vodom i miješajte 10 minuta. Tek tada treba otvoriti poklopac posude kako bi se očistili unutrašnji zidovi.
Tokom procesa čišćenja, poklopac i ventil za uzorkovanje moraju se očistiti, a potrebno je izvršiti kratko pročišćavanje dušikom dok je voda još uvijek unutar posude.
Za reaktor koji se neće koristiti neko vrijeme, najbolje je napuniti ga do 70% kapaciteta čistim bezvodnim etanolom za namakanje; vijke nije potrebno zatezati.
Pravilno čišćenje osigurava da je reaktor pod visokim pritiskom spreman za sljedeću upotrebu.